37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1964 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  100 
 
 		 395 aa  796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  51.41 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.46 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.46 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.92 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  25.29 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  21.08 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  21.2 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 		 495 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.45 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 1002 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.22 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  19.89 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0804  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 428 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>