46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0166 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
391 aa  798    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  51.41 
 
 
395 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
396 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
397 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.64 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  22.99 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.19 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  26.4 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.23 
 
 
1099 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.44 
 
 
461 aa  50.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.88 
 
 
433 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
433 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.88 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  22.89 
 
 
433 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  22.97 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  23.22 
 
 
497 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
425 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>