More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1842 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  100 
 
 
407 aa  841    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  69.04 
 
 
411 aa  620  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  43.27 
 
 
444 aa  342  9e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
435 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.49 
 
 
466 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.25 
 
 
466 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
415 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
418 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  33.42 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
417 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
437 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
438 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  34.49 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
397 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
398 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.24 
 
 
411 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
403 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
495 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
494 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  25.83 
 
 
439 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.73 
 
 
497 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  25.1 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.1 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.61 
 
 
1099 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
393 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
752 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 
1154 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  24.35 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.03 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
549 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
614 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  25.72 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.26 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.46 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.46 
 
 
433 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.27 
 
 
630 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.05 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.05 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
1002 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
507 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  23.72 
 
 
469 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.05 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  23.31 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
501 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
686 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.27 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.75 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.57 
 
 
520 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.17 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.04 
 
 
505 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
445 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
446 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
615 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
501 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
678 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
501 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>