More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5398 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
507 aa  1007    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  56.64 
 
 
513 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  42.04 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  39.35 
 
 
481 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.32 
 
 
461 aa  97.1  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 
1101 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.34 
 
 
694 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
1002 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.08 
 
 
1099 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
1120 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 
1124 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 
752 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.45 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25.45 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
1118 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
650 aa  73.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.3 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  22.17 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.3 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.77 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  23.33 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
772 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.62 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
398 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
789 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
243 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
789 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
789 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
632 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  24.32 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.07 
 
 
411 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
435 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
437 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.12 
 
 
503 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
438 aa  63.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.53 
 
 
422 aa  63.5  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
470 aa  63.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
481 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.68 
 
 
425 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  45.05 
 
 
222 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.68 
 
 
425 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  23.91 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.13 
 
 
422 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
421 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
421 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.68 
 
 
424 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
395 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  43.68 
 
 
222 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  25 
 
 
520 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
445 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
497 aa  61.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
505 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  30.48 
 
 
234 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.95 
 
 
442 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
232 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
549 aa  60.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
1154 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  25 
 
 
662 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25 
 
 
633 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
344 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 
268 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.15 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
236 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.29 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.9 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
233 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.52 
 
 
1115 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.41 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.7 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.7 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  21.12 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.7 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
802 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>