236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2574 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  97.47 
 
 		 395 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 395 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  91.39 
 
 		 395 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  68.86 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  43.47 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  47.04 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 401 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 418 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.58 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.58 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.38 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  26.62 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 1002 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  22.47 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.45 
 
 		 1115 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 1154 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.36 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  21.45 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  24.93 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  22.47 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.61 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.29 
 
 		 1115 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  21.45 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.36 
 
 		 1119 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  21.45 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.67 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  21.19 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.29 
 
 		 1115 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  22.05 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 425 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 425 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  42.7 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  22.4 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  20.78 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 1120 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.21 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 238 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26.34 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26.34 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26.34 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 632 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  43.82 
 
 		 243 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  21.05 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 475 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.25 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 425 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 658 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 228 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.8 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>