More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0652 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
301 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8510  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 
286 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
293 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4488  glycosyl transferase family 2  42.33 
 
 
273 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1942  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1573  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  34.74 
 
 
907 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2691  glycosyl transferase, family 2  35.14 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  36.24 
 
 
884 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0757  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
307 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0844  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 
475 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
393 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.58 
 
 
872 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.54 
 
 
1115 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.54 
 
 
927 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.54 
 
 
1115 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.54 
 
 
1119 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  32.11 
 
 
694 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
403 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
632 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  34.75 
 
 
236 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.84 
 
 
411 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.65 
 
 
1115 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
513 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
1115 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
406 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
395 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.86 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
1120 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
346 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.62 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
435 aa  56.2  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
235 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
235 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.07 
 
 
231 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
418 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
228 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  52.38 
 
 
235 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  37.19 
 
 
398 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
450 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.44 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
507 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
497 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2725  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
409 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 
523 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  38.61 
 
 
693 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  34.38 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 
752 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  47.13 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.67 
 
 
466 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
227 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
425 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
333 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.67 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
456 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
410 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.51 
 
 
1099 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
460 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.2 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  41.89 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
433 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
1154 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  34.51 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
396 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
402 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
411 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
496 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
388 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
402 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
443 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
402 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
1101 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  34.23 
 
 
425 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>