210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0844 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0844  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 
280 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2691  glycosyl transferase, family 2  35.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
293 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  36.08 
 
 
907 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1573  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
323 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1942  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8510  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0757  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  32.82 
 
 
884 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.59 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4488  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
535 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  32.41 
 
 
694 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
752 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
637 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.68 
 
 
193 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  33.61 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
632 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  29.03 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0303  hypothetical protein  35.24 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.371782  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
509 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 
1120 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.5 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
379 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.81 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
622 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
450 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.3 
 
 
1099 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
497 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
597 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
328 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
379 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
1032 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.09 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  32.04 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
1002 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
435 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
428 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
1038 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
466 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  29.91 
 
 
697 aa  49.3  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.85 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
380 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
445 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.36 
 
 
403 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
397 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  28.72 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  29.09 
 
 
435 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
430 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.89 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
322 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  25 
 
 
311 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.83 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  26.05 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.37 
 
 
295 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
983 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  26.8 
 
 
243 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.86 
 
 
347 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
333 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  23.15 
 
 
353 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
289 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
1015 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  35.87 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 
317 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
397 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.26 
 
 
408 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>