More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2268 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  83.66 
 
 
437 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
411 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  78.23 
 
 
421 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  77.72 
 
 
421 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  77.72 
 
 
421 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  60.55 
 
 
460 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  59.61 
 
 
435 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  65.81 
 
 
410 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  61.7 
 
 
416 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  56.16 
 
 
496 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  58.69 
 
 
412 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  63.12 
 
 
424 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  64.78 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  60.05 
 
 
415 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  57.97 
 
 
422 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  58.27 
 
 
425 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  58.35 
 
 
402 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  57.14 
 
 
428 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  59.21 
 
 
378 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  69.96 
 
 
266 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  63.27 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  43.27 
 
 
389 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  53.06 
 
 
441 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.3 
 
 
238 aa  226  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  52.49 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
606 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
613 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
237 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
239 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  36.44 
 
 
574 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  34.51 
 
 
238 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
238 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
238 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  43.8 
 
 
163 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
256 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
320 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
262 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
261 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
256 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
276 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.07 
 
 
259 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  29.63 
 
 
325 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
380 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
243 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  42.74 
 
 
168 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
245 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
276 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.96 
 
 
253 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
289 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
267 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
238 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
237 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
272 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
256 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.48 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
271 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
273 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
883 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  26.67 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
251 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.17 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.11 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
251 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.13 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  31.98 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  24.74 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.81 
 
 
809 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
231 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
250 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.63 
 
 
780 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.03 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.6 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  27.05 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  29.38 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  24.7 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.18 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.01 
 
 
248 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>