More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0439 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  100 
 
 
425 aa  842    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  68.73 
 
 
402 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  64.91 
 
 
428 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  57.97 
 
 
435 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  61.05 
 
 
421 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  61.05 
 
 
421 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  54.61 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  59 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  60.79 
 
 
421 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  57.4 
 
 
437 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  55.69 
 
 
416 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  58.06 
 
 
411 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  58.9 
 
 
415 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  60.15 
 
 
410 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  58.91 
 
 
424 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  60.66 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  55.67 
 
 
422 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  52.63 
 
 
412 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  56.76 
 
 
378 aa  325  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  47.75 
 
 
389 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  61.51 
 
 
333 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  61.98 
 
 
266 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  54.41 
 
 
441 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  52.84 
 
 
238 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  56.82 
 
 
326 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 
606 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
239 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  33.57 
 
 
574 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
613 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  36.02 
 
 
238 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
238 aa  123  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
255 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  30.83 
 
 
259 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  32.39 
 
 
253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
243 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
238 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
276 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
256 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
320 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
262 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
380 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
256 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
261 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
256 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  27.95 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
272 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
273 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
232 aa  92.8  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  41.09 
 
 
168 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
289 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  41.22 
 
 
163 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
236 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
245 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
243 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
267 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
237 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.27 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.75 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
246 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  29.19 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
231 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.38 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.1 
 
 
780 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 
809 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.56 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  29.05 
 
 
883 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.43 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.01 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  23.15 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.11 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.66 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 
346 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>