More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1870 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  57.47 
 
 
236 aa  268  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  58.56 
 
 
232 aa  266  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  54.3 
 
 
231 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  39.92 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
256 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
256 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  38.86 
 
 
259 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
380 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
289 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
271 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
238 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
239 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.91 
 
 
258 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
251 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.05 
 
 
265 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.05 
 
 
265 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.05 
 
 
265 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
496 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
267 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
238 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  32.46 
 
 
574 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
460 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.15 
 
 
305 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.19 
 
 
248 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
409 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.64 
 
 
261 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
421 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
421 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
441 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
421 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
238 aa  99  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
239 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
237 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
410 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.75 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.87 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  36.57 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
613 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
411 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.78 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  33.47 
 
 
435 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.38 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  35.24 
 
 
883 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
606 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.53 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
378 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  32.46 
 
 
389 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  33.2 
 
 
874 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
276 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
276 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.78 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
437 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
424 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.56 
 
 
257 aa  92  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
273 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.82 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  32.64 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.08 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.95 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.06 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  32.92 
 
 
428 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
416 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.44 
 
 
258 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.55 
 
 
780 aa  89  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.83 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  31.46 
 
 
425 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
394 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  27.72 
 
 
348 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.98 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.18 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.33 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  28.09 
 
 
388 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>