More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1701 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  88.41 
 
 
276 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  66.42 
 
 
261 aa  350  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  60.48 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  48.4 
 
 
255 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  46.77 
 
 
253 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
273 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  43.73 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  44.49 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
262 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  44.08 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
273 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
272 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  44.08 
 
 
289 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 
271 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.18 
 
 
780 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
245 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
243 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  34.87 
 
 
435 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
422 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  31.13 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 
613 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
424 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 
441 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
333 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
416 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
266 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
231 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
460 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.68 
 
 
402 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  33.33 
 
 
425 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
378 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
409 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
236 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
410 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
412 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  32.21 
 
 
574 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  31.12 
 
 
238 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
437 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  32.37 
 
 
428 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
238 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
411 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
326 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
496 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
606 aa  95.9  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
239 aa  95.5  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
268 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
237 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  31.36 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
304 aa  92  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
250 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
411 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
421 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
243 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
254 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  31.2 
 
 
874 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
430 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
415 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
245 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
597 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
337 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
394 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
414 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  29.07 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  28.83 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.18 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.18 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.18 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.79 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
414 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
586 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>