More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0828 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 422 aa  846    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  64.01 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  62.34 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  56.55 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  62.82 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  56.03 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  57.59 
 
 		 437 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  61.48 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  56.57 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  62.05 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  61.36 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  61.1 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  61.1 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  61.24 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  58.81 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  57.22 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  55.24 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  55.67 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  66.13 
 
 		 266 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  54.24 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  56.11 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  39.58 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  48.41 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  52.4 
 
 		 238 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  50.94 
 
 		 326 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  38.91 
 
 		 574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  40.47 
 
 		 606 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 613 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  38.94 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 		 239 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 238 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 273 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 256 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 		 256 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.12 
 
 		 253 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 267 aa  99.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 262 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 256 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  30.68 
 
 		 259 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 289 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 272 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 238 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 245 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  27.95 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 		 780 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  42.4 
 
 		 168 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 237 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 273 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 236 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.17 
 
 		 247 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.13 
 
 		 248 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 		 883 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  41.27 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.6 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.13 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.65 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  33.97 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  27.84 
 
 		 255 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  25.4 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  26.32 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  30.41 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  28.23 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.68 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.65 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.25 
 
 		 809 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 251 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 255 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.44 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>