More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3836 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
254 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  81.64 
 
 
256 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  57.09 
 
 
432 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3991  glycosyl transferase family protein  56.2 
 
 
253 aa  288  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  55.38 
 
 
434 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  54.84 
 
 
272 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 
586 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.22 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  29.34 
 
 
236 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
246 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 
809 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
320 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  30.32 
 
 
239 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
386 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.86 
 
 
257 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
320 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.91 
 
 
252 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
320 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
324 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
514 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
246 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 
239 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4190  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
294 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.84 
 
 
241 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.96 
 
 
246 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8170  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
250 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
321 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
262 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01640  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.08 
 
 
239 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
251 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.84 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.19 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5581  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148994  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
368 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  28.05 
 
 
328 aa  96.3  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
358 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.27 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  27.47 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  28.89 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.13 
 
 
384 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
251 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.7 
 
 
371 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
314 aa  92.8  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  26.83 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.71 
 
 
265 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.71 
 
 
265 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.71 
 
 
265 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
320 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2994  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.88 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  29 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.62 
 
 
359 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  28.44 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.89 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
313 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.96 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.89 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.45 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  27.98 
 
 
883 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  25.73 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
256 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
276 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2710  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  27.53 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  28.57 
 
 
310 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.31 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.28 
 
 
232 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2805  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.7 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.94 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>