More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4956 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  49.37 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  36.21 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  36.12 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 		 320 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 378 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.07 
 
 		 780 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 460 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 496 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 409 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 416 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  32.17 
 
 		 389 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 410 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 437 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 411 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 441 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  35.27 
 
 		 428 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  33.97 
 
 		 435 aa  98.2  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 326 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 412 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.79 
 
 		 402 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 415 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 424 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  31.47 
 
 		 325 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  32.85 
 
 		 425 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 430 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 422 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  27.33 
 
 		 405 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 304 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 421 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 421 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 421 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.46 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.91 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 386 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.43 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.8 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3541  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.62234  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.81 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 613 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  29.38 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.51 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.66 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  25 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.86 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.64 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  34.98 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.62 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.64 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  24 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>