More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0724 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  74.37 
 
 
238 aa  363  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  66.81 
 
 
238 aa  330  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  68.62 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  61.9 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  53.97 
 
 
613 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  56 
 
 
574 aa  241  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 
606 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
238 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  37.07 
 
 
435 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  38.26 
 
 
428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
496 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 
378 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
410 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
409 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
266 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.92 
 
 
402 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
422 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  40.89 
 
 
425 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
424 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
411 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
437 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
421 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
421 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
421 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
416 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
441 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 
412 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
333 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
326 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
380 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
320 aa  121  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
262 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.49 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  28.45 
 
 
325 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  33.49 
 
 
389 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
271 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.9 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
256 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
237 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
236 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
276 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
231 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
256 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
273 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
276 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 
247 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 
780 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.4 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
337 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
586 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
323 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  29.91 
 
 
328 aa  89.4  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
334 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
312 aa  88.2  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
597 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.03 
 
 
332 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  31.72 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
267 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.66 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  31.95 
 
 
320 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.02 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2624  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.62 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
304 aa  85.1  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.63 
 
 
809 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  27.54 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.85 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2710  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.07 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>