More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1908 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 780 aa  1599    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  42.08 
 
 		 259 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  38.08 
 
 		 253 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 256 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 273 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 256 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 262 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 255 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 273 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 289 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 261 aa  134  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 256 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 276 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 272 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 271 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 243 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 		 380 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 298 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 245 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 238 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  32.98 
 
 		 348 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  31.58 
 
 		 325 aa  108  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 		 606 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 267 aa  103  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 		 613 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 241 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  30.87 
 
 		 574 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 410 aa  95.1  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 236 aa  95.1  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 378 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 266 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 267 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 409 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 304 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  29.46 
 
 		 435 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  30.05 
 
 		 389 aa  92  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 239 aa  91.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.46 
 
 		 359 aa  91.3  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  26.41 
 
 		 238 aa  90.9  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  26.44 
 
 		 236 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 245 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 285 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 424 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 252 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 237 aa  89  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  25.41 
 
 		 405 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.64 
 
 		 402 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 437 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 232 aa  87.8  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 496 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 238 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 586 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 238 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 243 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 252 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1783  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.5 
 
 		 236 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 249 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 337 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 415 aa  83.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  27.18 
 
 		 239 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  26.92 
 
 		 255 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  27.87 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  30.9 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 460 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  28.1 
 
 		 252 aa  80.5  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 324 aa  80.9  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.52 
 
 		 245 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 243 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.02 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 421 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 421 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.13 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.2 
 
 		 248 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>