More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1721 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 424 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  65.09 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  61.25 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  62.65 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  65.45 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  67.11 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  66.84 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  66.84 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  66.32 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  61.14 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  60.55 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  62.76 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  65.3 
 
 		 409 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  56.36 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  60.4 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  58.6 
 
 		 415 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  58.65 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  59.23 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  70.28 
 
 		 266 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  65.31 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  55.18 
 
 		 378 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  41.85 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  50.93 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  50.87 
 
 		 238 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  55.41 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  38.86 
 
 		 574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 613 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  35.65 
 
 		 238 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 606 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 239 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 		 238 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 238 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.64 
 
 		 259 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 		 267 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 261 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  27.2 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  45.6 
 
 		 168 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.64 
 
 		 236 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 272 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.44 
 
 		 248 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  44.44 
 
 		 163 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  36.36 
 
 		 883 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 237 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.75 
 
 		 780 aa  94  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.2 
 
 		 258 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 245 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.54 
 
 		 247 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.28 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 238 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.2 
 
 		 255 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 267 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 236 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.74 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 232 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.1 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.78 
 
 		 264 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.67 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.49 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.22 
 
 		 809 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  32.57 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.83 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 685 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.26 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.06 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  27.56 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  27.56 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.76 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>