More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1414 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  88.41 
 
 		 276 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  65.91 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  60.08 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  51.01 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  46.85 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  45.74 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  44.36 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  45.04 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  44.35 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  43.44 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  35.58 
 
 		 435 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.86 
 
 		 780 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 		 613 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 		 424 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  33.7 
 
 		 425 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  33.08 
 
 		 428 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  31.52 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 416 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  34.8 
 
 		 574 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 422 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 437 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 496 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 238 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 606 aa  99  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  31.84 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 421 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 421 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 421 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 		 415 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  30.62 
 
 		 389 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.34 
 
 		 597 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  32.55 
 
 		 874 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 394 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.34 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.34 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.46 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  28.95 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 411 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 318 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 386 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 414 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>