More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1923 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  73.39 
 
 
437 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  73.89 
 
 
424 aa  331  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  69.96 
 
 
411 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  71.55 
 
 
496 aa  325  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  66.41 
 
 
416 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  69.83 
 
 
409 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  71.18 
 
 
410 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  66.53 
 
 
435 aa  314  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  62.78 
 
 
428 aa  314  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  67.69 
 
 
460 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  71.04 
 
 
421 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  71.04 
 
 
421 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  71.04 
 
 
421 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  63.91 
 
 
412 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  66.13 
 
 
422 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  64.43 
 
 
415 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  71.24 
 
 
378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  63.52 
 
 
402 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  64.1 
 
 
333 aa  297  9e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  61.98 
 
 
425 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  52.24 
 
 
441 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.1 
 
 
238 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  51.53 
 
 
389 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  57.01 
 
 
326 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  42.27 
 
 
606 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 
613 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
237 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
239 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  37.17 
 
 
238 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  36.36 
 
 
574 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  34.55 
 
 
259 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
255 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
243 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
320 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
276 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
262 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
245 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
276 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
380 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
273 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
256 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
261 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
272 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  26.95 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.49 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.54 
 
 
780 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
238 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.6 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.3 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.51 
 
 
809 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
243 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.01 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.87 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.91 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.48 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.17 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.69 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
883 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.55 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.7 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.04 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.02 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.96 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
231 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.56 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3205  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105358  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
597 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  29.06 
 
 
410 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  25.5 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  28.5 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.47 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  34.29 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>