More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0902 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  100 
 
 
428 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  69.79 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  64.91 
 
 
425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  60.41 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  59.66 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  53.91 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  57.07 
 
 
460 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  61.44 
 
 
421 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  61.17 
 
 
421 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  61.17 
 
 
421 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  60.31 
 
 
416 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  61.08 
 
 
410 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  57.03 
 
 
411 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  56.96 
 
 
422 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  56.48 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  57.77 
 
 
415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  59.08 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  59.54 
 
 
409 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  57.67 
 
 
378 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  62.78 
 
 
266 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  64.63 
 
 
333 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  45.24 
 
 
389 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  55.74 
 
 
441 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  51.63 
 
 
326 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.98 
 
 
238 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  36.96 
 
 
238 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  37 
 
 
574 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
606 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
239 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
613 aa  140  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
238 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
238 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
255 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.93 
 
 
259 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
262 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
256 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
256 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
320 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
380 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
276 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  30.04 
 
 
325 aa  99.8  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
245 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
273 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
273 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
256 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
238 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
261 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
267 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
236 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.03 
 
 
252 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
243 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
237 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.07 
 
 
246 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
246 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  30.94 
 
 
883 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  39.37 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.87 
 
 
780 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.77 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
243 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.53 
 
 
247 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  36.22 
 
 
163 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29 
 
 
809 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  32.06 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
514 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.2 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
246 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
232 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.33 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.38 
 
 
248 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.43 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
251 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  30.14 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  28.23 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.19 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>