27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2293 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  100 
 
 
163 aa  320  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  72.02 
 
 
168 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  44.27 
 
 
421 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
421 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
421 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
496 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  46.4 
 
 
437 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  45.67 
 
 
460 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  43.8 
 
 
411 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  43.66 
 
 
412 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  40.62 
 
 
435 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
416 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  42.4 
 
 
410 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
424 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  41.27 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  40.15 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  41.22 
 
 
425 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 
409 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
415 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
378 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  31.65 
 
 
428 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  28.57 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  27.41 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1200  hypothetical protein  31.51 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.788905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  24.46 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  23.57 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  29.32 
 
 
221 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>