17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1200 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.788905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2000  hypothetical protein  37.86 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0923635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 411 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 496 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 424 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 416 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 412 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 437 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  30.14 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  32.19 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  43.86 
 
 		 409 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  28.79 
 
 		 435 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>