More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3997 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
421 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
421 aa  827    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  78.91 
 
 
437 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  99.52 
 
 
421 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  77.55 
 
 
411 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  65.16 
 
 
460 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  60 
 
 
496 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  65.5 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  65.55 
 
 
416 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  67.65 
 
 
410 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  67.53 
 
 
424 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  66.5 
 
 
409 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  60.4 
 
 
422 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  58.96 
 
 
412 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  60.79 
 
 
415 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  59.85 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  60.82 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  60.97 
 
 
428 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  60.42 
 
 
378 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  71.55 
 
 
266 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  66.13 
 
 
333 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  44.39 
 
 
389 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  49.43 
 
 
441 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
238 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
326 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
237 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 
613 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
239 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  36.48 
 
 
574 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  36.06 
 
 
238 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
238 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
238 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
255 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.18 
 
 
259 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
243 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
261 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
237 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
276 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  46.15 
 
 
168 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
238 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
380 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
267 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
256 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
276 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  43.51 
 
 
163 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
256 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  29.55 
 
 
253 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
289 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
262 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  29.52 
 
 
325 aa  99  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
236 aa  97.1  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
272 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
256 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
273 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.43 
 
 
780 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.1 
 
 
247 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
263 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.36 
 
 
305 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.1 
 
 
248 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
394 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  27.67 
 
 
236 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
251 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
271 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.04 
 
 
809 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  32.26 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
231 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
883 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.6 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.48 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.17 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.45 
 
 
255 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.02 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.25 
 
 
246 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.53 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4086  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  29.58 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.29 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  28.23 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>