58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  100 
 
 		 180 aa  361  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  60.34 
 
 		 171 aa  222  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  67.08 
 
 		 186 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  58.43 
 
 		 184 aa  213  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  58.54 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  58.54 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  58.54 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  58.54 
 
 		 227 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  56.71 
 
 		 272 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  57.32 
 
 		 240 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  52.8 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  47.53 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  45.71 
 
 		 186 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  34.36 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  38.31 
 
 		 220 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  38.46 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  35.71 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  37.31 
 
 		 267 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  36.5 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  34.78 
 
 		 163 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  32.53 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  33.12 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  32.93 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  34.27 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.5 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  35.82 
 
 		 267 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  34.36 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  32.59 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  30.52 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  32.84 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  37.74 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  29.8 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  38.97 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  35.82 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  35.25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  33.58 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  28.07 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  30.28 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  38.41 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  30.99 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.43 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.04 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  32.47 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  27.66 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.03 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  31.65 
 
 		 125 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  31.65 
 
 		 125 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.94 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  31.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  32.09 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  32.93 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  27.78 
 
 		 121 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 416 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  27.41 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>