30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4545 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  100 
 
 
125 aa  239  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  92.8 
 
 
125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  63.41 
 
 
124 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  42.52 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  43.44 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  29.41 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  29.41 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.53 
 
 
180 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  29.71 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  31.82 
 
 
180 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  30.88 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  29.71 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  44.07 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  29.93 
 
 
240 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  28.99 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  30.3 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  27.21 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  31.71 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.2 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  27.54 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  25.62 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  25.71 
 
 
200 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  31.78 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  30.91 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  36.67 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  31.9 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  27.05 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.039698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>