25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0715 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  70.42 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  38.53 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  35.71 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  33.71 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  37.04 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  37.88 
 
 		 267 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  34.88 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.51 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  33.33 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  34.67 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  34.85 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  29.11 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  30.23 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  34.83 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  32.85 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  34.29 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  29.66 
 
 		 521 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.29 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  31.43 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  32.18 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  27.85 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  30.77 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>