34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2294 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  100 
 
 
152 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  46.51 
 
 
129 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  44.19 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  31.15 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  40.48 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  29.77 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.71 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16020  hypothetical protein  56.36 
 
 
59 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000816114  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  27.87 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  27.87 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.91 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  29.03 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  29.51 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  30.53 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  27.59 
 
 
171 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  34.12 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  29.55 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  30.7 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  31.71 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  27.42 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  29.71 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  29.33 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  30.34 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  26.39 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  27.5 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  25.52 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  25.96 
 
 
184 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  32 
 
 
158 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  29.27 
 
 
206 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  32.52 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  37.88 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  28.57 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  37.88 
 
 
184 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>