30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0149 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  100 
 
 		 124 aa  231  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  63.41 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  65.85 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  43.55 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  35.2 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  38.41 
 
 		 180 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  28.23 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  28.23 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.37 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  28.46 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  31.45 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  34.15 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  40.28 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  28.15 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  28.15 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  27.41 
 
 		 272 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  32.58 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  34.09 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.15 
 
 		 229 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.15 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.15 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  30.7 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  30.43 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  31.75 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  33.08 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  34.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  30 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  29.41 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  47.46 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>