57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13306 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  77.06 
 
 		 240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  76.52 
 
 		 229 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  76.52 
 
 		 229 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  76.52 
 
 		 229 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  76.32 
 
 		 227 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  64.6 
 
 		 186 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  56.63 
 
 		 186 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  53.67 
 
 		 194 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  54.55 
 
 		 184 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  56.71 
 
 		 180 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  53.94 
 
 		 171 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  48.07 
 
 		 200 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  39.58 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  40.15 
 
 		 180 aa  96.3  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  42.96 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  39.33 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  34.29 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  36.43 
 
 		 190 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 202 aa  85.5  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  31.88 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  35.46 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  35.71 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  32.76 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  34.88 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  39.26 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  31.52 
 
 		 169 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  33.14 
 
 		 162 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  34.71 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  33.82 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  31.72 
 
 		 158 aa  72  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  39.62 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.58 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.77 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  27.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  33.11 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.43 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  31.87 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  27.46 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  32.62 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  29.58 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  28.28 
 
 		 176 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  28.39 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  27.54 
 
 		 125 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  28.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  28.95 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  27.41 
 
 		 124 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 416 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  27.54 
 
 		 125 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.9 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  29.58 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  23.13 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  22.3 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  36.76 
 
 		 131 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>