53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5907 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  72.16 
 
 		 190 aa  278  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  48.2 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  49.24 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  46.1 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  45.45 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  47.76 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  43.71 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  48.85 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  48.87 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  42.38 
 
 		 267 aa  121  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  43.57 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  40.74 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  41.89 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  40.25 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  39.35 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  45.8 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  36.57 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  44.27 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  40 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  36.9 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  36 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  35.14 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  34.81 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  40 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  36.54 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  38.46 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  41.3 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  45.45 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  35.46 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  36.17 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  35.46 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  35.77 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  36.03 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  36.03 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  35.17 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  30.97 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  32.54 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  34.59 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  28.85 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  32.95 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  34.35 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35 
 
 		 165 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  33.59 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  29.67 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.05 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  26.37 
 
 		 164 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26.95 
 
 		 155 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  30.23 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  24.79 
 
 		 131 aa  41.2  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  26.36 
 
 		 143 aa  41.2  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>