47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0838 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  45.1 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  41.01 
 
 		 267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  41.56 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  45.8 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  40 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  36.22 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  44.23 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  40.43 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  43.54 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  40.52 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  39.26 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  36.62 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  40.6 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  44.59 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  39.1 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  43.85 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  33.15 
 
 		 202 aa  93.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  35.77 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  32.93 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  37.5 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  34.03 
 
 		 229 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  34.03 
 
 		 229 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  34.03 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  37.32 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  33.58 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  34.31 
 
 		 240 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  31.36 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  32.39 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35.77 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  38 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  33.58 
 
 		 272 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  37.01 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  34.31 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  33.12 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  31.62 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  35.25 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  33.58 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  31.01 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  33.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  39.29 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  32.1 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  30.67 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  27.86 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.01 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  23.61 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0245  GtrA family protein  32.86 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.322541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>