47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0837 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  34.72 
 
 		 169 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  36.36 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  38.41 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  33.77 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  30.39 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  32.98 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  33.33 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  32.14 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  34.03 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  32.31 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  32.16 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  33.1 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  31.06 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  36.5 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  32.41 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  30.34 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  30.28 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  31.65 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  28.76 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  32.24 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  31.72 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  32.24 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  29.75 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  27.92 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  31.87 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  30.27 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.09 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.48 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.94 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  30.3 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  27.74 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  33.33 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  31.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  34.48 
 
 		 154 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  25.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  30.94 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  33.81 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  36.59 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  29.21 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  31.52 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  30.11 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.38 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  29.47 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>