52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0806 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  83.52 
 
 		 267 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  45.91 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  38.12 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  45.86 
 
 		 221 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  46.9 
 
 		 155 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  42.38 
 
 		 191 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  46.88 
 
 		 162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  42.86 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  45.1 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  42.14 
 
 		 190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  44.29 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  46.75 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  43.15 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  41.5 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  44.44 
 
 		 230 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  43.51 
 
 		 147 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  39.66 
 
 		 220 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  40.11 
 
 		 180 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  42.25 
 
 		 166 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  38.67 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  38.67 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  38.67 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  36.57 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  39.33 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  41.04 
 
 		 186 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  38.04 
 
 		 171 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  38 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  38.67 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  40 
 
 		 158 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  38.52 
 
 		 202 aa  89.7  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  38.62 
 
 		 169 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  36.23 
 
 		 151 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  34.64 
 
 		 188 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  34.78 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  35.82 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  46.94 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.95 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  34.81 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  33.77 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  31.03 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  34.07 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35.17 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  29.17 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  27.4 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  31.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  24.32 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1645  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.3 
 
 		 377 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  36.23 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  34.85 
 
 		 142 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  28.95 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3189  GtrA family protein  29.73 
 
 		 703 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0515791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>