58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0859 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  89.18 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  51.32 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  42.31 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  44.44 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  45.83 
 
 		 165 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  42.36 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  43.51 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  44.27 
 
 		 191 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  41.83 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  43.88 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  43.15 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  41.48 
 
 		 163 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  44.59 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  32.65 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  32.65 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  43.08 
 
 		 169 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  32.65 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  37.88 
 
 		 151 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  33.52 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  34.88 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  36.3 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  33.13 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  40.15 
 
 		 180 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  36.99 
 
 		 155 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  39.19 
 
 		 155 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  43.8 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  36.22 
 
 		 202 aa  85.1  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  36.76 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  38.73 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  39.86 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  35.07 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  35.1 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  32.64 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  32.09 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  39.19 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  35.76 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  38.28 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  33.58 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  31.71 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  37.78 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  32.67 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  43.48 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  31.78 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  25.53 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  29.93 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3658  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.06 
 
 		 377 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1800  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.3 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0148335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  31.16 
 
 		 162 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4305  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 386 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  27.55 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  27.35 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  32.47 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  36.78 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  31.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0245  GtrA family protein  29.77 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.322541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>