45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4648 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  100 
 
 		 165 aa  324  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  47.06 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  37.24 
 
 		 220 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  42.86 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  35.15 
 
 		 267 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  36.96 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  35.95 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  35.51 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  34.01 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35.62 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  39.49 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  35.15 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  34.21 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  34.19 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  39.01 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  45 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  33.79 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  35.37 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  34.75 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  32.14 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.05 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  33.57 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  31.13 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  33.57 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  30.77 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  33.57 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  32.88 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  32.72 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.91 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  32.62 
 
 		 272 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  33.55 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  34.84 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.67 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  31.51 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  31.51 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  28.08 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  26.67 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  32.03 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  31.51 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  30.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  29.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  31.79 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  29.05 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.28 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>