52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3907 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  52.29 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  55.3 
 
 		 163 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  48.72 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  50 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  46.99 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  52.17 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  41.28 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  46.63 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  45.45 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  50 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  46.62 
 
 		 155 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  41.67 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  42.86 
 
 		 267 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  45.12 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  37.82 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  40.44 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  41.61 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  42.22 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  34.62 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  40.69 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  40.69 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  40.69 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  36.22 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  40.28 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  39.58 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  40.28 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  43.15 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  41.78 
 
 		 231 aa  94.4  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  36.42 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.36 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  38.51 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  33.73 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  45.36 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  34.69 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.64 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  39.16 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  35.48 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  28.26 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  30.9 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  36.97 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  33.58 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  30.77 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  33.56 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35.04 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  32.98 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.53 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 386 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.27 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  34.15 
 
 		 142 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  32.18 
 
 		 142 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>