64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6378 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  65.68 
 
 		 186 aa  241  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  58.43 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  56.14 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  58.43 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  54.55 
 
 		 272 aa  201  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  55.15 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  55.15 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  55.15 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  51.4 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  53.94 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  56.64 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  46.29 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  33.73 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  32.17 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  37.14 
 
 		 166 aa  90.9  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  37.96 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  36 
 
 		 267 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36.54 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  38.13 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  37.18 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  31.68 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  36.3 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  34.78 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  30.54 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  34.03 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.26 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  29.71 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  31.62 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  37.32 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  29.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  32 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  35.07 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  30 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  32.3 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  34.33 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  33.33 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  31.65 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  30.13 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  29.08 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  26.11 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  30.77 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  25.79 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  34.62 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  30.37 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  25.17 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  26.81 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  24.63 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  26.81 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  31.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28 
 
 		 397 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  25.68 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  25.96 
 
 		 152 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  27.88 
 
 		 155 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.73 
 
 		 376 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  24.07 
 
 		 135 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  27.66 
 
 		 165 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3088  GtrA family protein  25 
 
 		 703 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  31.75 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.84 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  28.09 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  23.57 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  19.75 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>