39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1564 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  56.76 
 
 		 176 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  35.07 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  33.08 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  31.36 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  25.36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  29.84 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  29.77 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  35.16 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  35.42 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  30.65 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  31.71 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  30.14 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  31.71 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  30.89 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  30.51 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1800  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.34 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0148335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  26.87 
 
 		 227 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3658  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.56 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  27.61 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6498  GtrA family protein  32.26 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  26.05 
 
 		 194 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 402 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4305  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 386 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  29.66 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  31.75 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  29.66 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5297  putative dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.19 
 
 		 377 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  24.31 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  27.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  27.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  27.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  29.66 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  29.66 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  32.2 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  32.2 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  32.2 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0526  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.87 
 
 		 340 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>