14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4236 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  100 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  56.76 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  29.84 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  23.9 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  35.04 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3886  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.47 
 
 		 397 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3189  GtrA family protein  31.03 
 
 		 703 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0515791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.12 
 
 		 397 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  30.65 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  31.25 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  26.4 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  34.23 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  28.46 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>