16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1342 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  100 
 
 		 169 aa  337  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  37.41 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1394  GtcA family membrane protein  34.92 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  30.77 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0698  GtcA family membrane protein  29.17 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1745  GtcA family membrane protein  30.06 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  24.03 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  24.03 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  24.8 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  23.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  26.83 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.03 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  22.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  24.27 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  24.31 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>