17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2009 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  71.65 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  71.65 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  28.69 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  33.08 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.69 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  23.39 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  27.27 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  27.17 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  25.89 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  28.81 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  31.4 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  28.07 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  28.07 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  28.07 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4307  GtrA family protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>