28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2172 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  25.37 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  28.57 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  32.56 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  23.39 
 
 		 128 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  30.89 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  29.13 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  33.6 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  33.06 
 
 		 128 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  33.06 
 
 		 128 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  33.06 
 
 		 128 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  30.08 
 
 		 128 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  28.35 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  27.08 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  27.08 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  32.84 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  25.71 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  26.15 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  27.34 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  31.65 
 
 		 435 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  33.06 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  35.06 
 
 		 435 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  29.84 
 
 		 127 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>