30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1247 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  100 
 
 
128 aa  244  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  39.47 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  45.76 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  43.43 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  36 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  38.98 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  33.87 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  36.21 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  33.07 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0770  GtrA-like protein  37.93 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  47.22 
 
 
412 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  33.07 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  34.4 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  31.36 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  35.66 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  33.62 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  32.77 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  32 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  32 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  32 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  46.77 
 
 
395 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  40 
 
 
435 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  35.11 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  33.04 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  33.04 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  33.04 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  33.04 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>