18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1525 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  100 
 
 
148 aa  285  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  43.33 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  42.74 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  40.34 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0770  GtrA-like protein  46.55 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  42.98 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  29.01 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  39.68 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  42.64 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  31.2 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  29.51 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  27.2 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  31.71 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  32.65 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  30.83 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  30.83 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  30.83 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  30.83 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>