18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2399 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  254  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  43.24 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  43.3 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  36.21 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  36.75 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  36.22 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  39.47 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0770  GtrA-like protein  34.19 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  27.64 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  27.43 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  28.35 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  26.23 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  40.3 
 
 
412 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  34.33 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  34.33 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  42.19 
 
 
134 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  32.84 
 
 
127 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>