108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0193 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  836    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  61.75 
 
 
395 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  49.88 
 
 
435 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  28.94 
 
 
288 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.19 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  33.2 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  30.09 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  28.51 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  25.74 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  25.74 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  25.74 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  27.65 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.5 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  25.74 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  25.74 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.83 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  27.68 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.23 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  27.68 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  27.68 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.68 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  25.27 
 
 
295 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  27.15 
 
 
294 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  26.1 
 
 
295 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.9 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  29.46 
 
 
291 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  25.9 
 
 
292 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  30.73 
 
 
304 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.34 
 
 
252 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.98 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  27.43 
 
 
265 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  29.45 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  29.45 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  29.45 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  29.45 
 
 
249 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  30.82 
 
 
272 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  27.23 
 
 
289 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  31.29 
 
 
252 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  25.27 
 
 
276 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  31.33 
 
 
252 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.74 
 
 
252 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  26.52 
 
 
275 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  28.92 
 
 
252 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  30.43 
 
 
278 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  28.64 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  27.89 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  26.62 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  26.62 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  27.89 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  27.7 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  28.92 
 
 
252 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  28.92 
 
 
252 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  27.05 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  28.83 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  24.55 
 
 
270 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  29.38 
 
 
293 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  28.92 
 
 
252 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  28.83 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  30.34 
 
 
307 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  33.17 
 
 
249 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  24.88 
 
 
257 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  26.15 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  33.17 
 
 
249 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  24.43 
 
 
234 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  27.08 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  29.17 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  31.21 
 
 
245 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  23.3 
 
 
234 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  25.83 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  27.73 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.21 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  24.16 
 
 
234 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  25.82 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  28.57 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  27.48 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.32 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30 
 
 
293 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  27.33 
 
 
247 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  30.91 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.24 
 
 
274 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.3 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  32.3 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  24.34 
 
 
235 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  27.56 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  27.06 
 
 
235 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  34.26 
 
 
244 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  29.03 
 
 
288 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  23.13 
 
 
249 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  28.67 
 
 
254 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.95 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  25.97 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  33.11 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.45 
 
 
280 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  23.91 
 
 
251 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  26.06 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>