23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1381 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  100 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  45.61 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  42.5 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  44.44 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  44.44 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  40.83 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  44.44 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  42.74 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  45.76 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  42.74 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  41.88 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  41.88 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  40 
 
 		 128 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  41.88 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  26.23 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  27.34 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  38.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  36.23 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>