22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5987 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  100 
 
 		 127 aa  253  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  97.64 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  73.23 
 
 		 127 aa  189  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  73.23 
 
 		 127 aa  189  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  72.44 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  64.8 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  65.29 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  65.29 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  65.29 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  49.58 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  47.9 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  47.9 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  47.9 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  41.53 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  40.68 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  45.76 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  42.74 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  40 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  34.52 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  32.54 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  22.76 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>