25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6283 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  97.64 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  73.23 
 
 		 127 aa  190  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  73.23 
 
 		 127 aa  190  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  72.44 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  65.6 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  66.12 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  66.12 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  66.12 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  48.74 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  42.37 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  46.61 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  39.83 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  40 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  34.07 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  32.54 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  29.27 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.27 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  29.27 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  20 
 
 		 137 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>