22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2257 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  100 
 
 
128 aa  253  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  91.41 
 
 
128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  91.41 
 
 
128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  91.41 
 
 
128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  67.97 
 
 
129 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  65.6 
 
 
127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  64.8 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  64.52 
 
 
127 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  64.52 
 
 
127 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  64.52 
 
 
127 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  62.18 
 
 
128 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  61.34 
 
 
128 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  61.34 
 
 
128 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  61.34 
 
 
128 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  47.86 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  48.31 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  49.57 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  39.84 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  42.74 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.81 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  30.89 
 
 
173 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25.4 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>